ctDNA精準(zhǔn)測序難點新突破

　　在3月6日-11日舉行的舊金山分子醫(yī)學(xué)三方會議（TheMolecularMedicineTri-Conference）上，安可濟(jì)（AccuraGen）公司的聯(lián)合創(chuàng)始人兼科研總監(jiān)趙奇志（GraceZhao）博士首次發(fā)表了安可濟(jì)獨創(chuàng)的ctDNA高通量測序技術(shù)FireflyTM的原理，及其和國際主流技術(shù)的性能比較，證明基于FireflyTM技術(shù)開發(fā)的基因液態(tài)活檢產(chǎn)品可能是目前國際上性能最好的ctDNA高通量測序產(chǎn)品。這意味著由中國海外學(xué)者創(chuàng)始的這家國際公司在腫瘤液態(tài)活檢領(lǐng)域走在了世界前列。
　　
　　日前，國際知名基因組專業(yè)網(wǎng)站GenomeWeb對此做了報道。舊金山分子醫(yī)學(xué)三方會議已有23年歷史，聚焦分子醫(yī)學(xué)，涵蓋新藥研發(fā)、基因組學(xué)、體外診斷、生物信息、商務(wù)策略、平臺開發(fā)等多領(lǐng)域，是診斷方法與新藥研發(fā)領(lǐng)域相關(guān)人士不可錯過的一流國際盛會。
　　
　　液態(tài)活檢是腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域炙手可熱的明星技術(shù)。循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）高通量測序技術(shù)是液態(tài)活檢的一種，也是最具前景的。它只需像化驗肝腎功能那樣采集靜脈血，即可對全身的腫瘤基因信息進(jìn)行精確測定，基于腫瘤基因信息，就可以指導(dǎo)抗腫瘤藥物選用、療效評估、預(yù)后判斷，甚至早期發(fā)現(xiàn)和早期診斷。然而，精確測序ctDNA存在兩個巨大技術(shù)障礙：首先是血漿中的ctDNA含量極低，做不了幾個檢測反應(yīng)。其次是二代測序背景噪聲很高，用常規(guī)建庫測序方法腫瘤信號完全淹沒在背景噪聲中。全球這一領(lǐng)域的頂尖高手都在致力于攻克這兩個難題。
　　
　　在3月11日的循環(huán)腫瘤DNA分會場上，趙奇志博士主持了會議，并報告了FireflyTM技術(shù)的原理與進(jìn)展。安可濟(jì)采用單鏈環(huán)化DNA滾環(huán)復(fù)制串聯(lián)重復(fù)確認(rèn)法，取代國際主流的雙鏈DNA分子條碼擴(kuò)增比對確認(rèn)法，在解決了微量的循環(huán)腫瘤DNA擴(kuò)增難題的同時極大地提高了檢測靈敏度和特異性?；谠摷夹g(shù)開發(fā)的涵蓋61個基因測序的安可行TM產(chǎn)品已經(jīng)完成了性能驗證，正在中國推進(jìn)針對不同癌癥種類的6個臨床合作研究項目。臨床研究結(jié)果證明了在晚期肺癌病例中，ctDNA與組織測序98%病例符合率和高達(dá)87%位點符合率。通過對胰腺癌的近兩年的研究觀察，發(fā)現(xiàn)了ctDNA突變譜與預(yù)后和化療獲益率之間的相關(guān)性。在直結(jié)腸癌指導(dǎo)用藥研究中，發(fā)現(xiàn)了明確的ctDNA與療效和復(fù)發(fā)的相關(guān)性。這些研究成果已經(jīng)投稿今年六月的美國臨床腫瘤學(xué)會（ASCO）年會，也為下一步產(chǎn)品開發(fā)奠定了堅實的基礎(chǔ)。若干年前，蘋果創(chuàng)始人喬布斯花10萬美金進(jìn)行腫瘤基因測序，還只能取材腫瘤組織活檢標(biāo)本，這在實際應(yīng)用中有很大局限。而只需采血的液態(tài)活檢則應(yīng)用極為方便。不僅如此，組織活檢像切蛋糕一樣，只檢測了腫瘤的一部分，而循環(huán)血中的ctDNA則能反映腫瘤全貌，這對全面了解腫瘤特征、精準(zhǔn)給藥提供了前所未有的視野。
　　
　　目前，兩年多年前初創(chuàng)于美國加州PaloAlto的安可濟(jì)公司已經(jīng)遷至MenloPark，形成了國際一流的研發(fā)團(tuán)隊，同時，在中國上海設(shè)立了首個醫(yī)學(xué)檢驗所和商業(yè)推廣機(jī)構(gòu)。據(jù)悉，該公司近期將有進(jìn)一步發(fā)展布局，十分值得期待。