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《環(huán)境微生物宏基因組檢測 高通量測序法》意見征集

作者: 2020年03月27日 來源:全球化工設備網(wǎng) 瀏覽量: 403 Forbidden

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為了確保高通量測序技術的有序應用,深圳華大基因科技有限公司、深圳基因產(chǎn)學研資聯(lián)盟、中國測試技術研究院、深圳華大臨床檢驗中心在國家標準化管理委員會的主管下,起草編制了《環(huán)境微生物宏基因組檢測 高通量測序
  隨著人們對環(huán)境微生物認識的不斷加深,在環(huán)境監(jiān)測、治理,工、農業(yè)生產(chǎn)及健康評估、疾病診斷等領域,微生物的重要性正在不斷凸顯,對環(huán)境中微生物的種類與豐度進行定性、定量檢測也成了科學研究與實踐應用的基礎,并直接關系著科研結果的可信度與生產(chǎn)應用的可靠性。
 
  高通量測序技術的快速發(fā)展使得目前對環(huán)境微生物的研究擺脫了對于微生物培養(yǎng)技術的依賴,但目前國內并沒有相對應的檢測標準出臺,復雜的環(huán)境微生物群落,不規(guī)范的檢測方法,也造成了檢測數(shù)據(jù)的混亂及結論、結果的矛盾。為了確保高通量測序技術的有序應用,深圳華大基因科技有限公司、深圳基因產(chǎn)學研資聯(lián)盟、中國測試技術研究院、深圳華大臨床檢驗中心在國家標準化管理委員會的主管下,起草編制了《環(huán)境微生物宏基因組檢測 高通量測序法》。
 
  經(jīng)過技術調研、咨詢、收集和消化有關資料,結合環(huán)境微生物宏基因組檢測方法及高通量測序技術的應用,編制組遵循統(tǒng)一性、協(xié)調性、適用性、一致性、規(guī)范性的原則,本著先進性、科學性、合理性和可操作性的原則,依據(jù)GB/T 1.1-2009《標準化工作導則 第1部分:標準的結構和編寫》給出的規(guī)則并參照了GB/T 20001.4—2015《標準編寫規(guī)則 第4部分:實驗方法標準》,在引用了GB/T 6682《分析試驗室用水規(guī)格和實驗方法》、GB 19489-2008《實驗室生物安全通用要求》、GB/T 19495.5-2004《轉基因產(chǎn)品檢測核酸定量 PCR檢測方法》、GB/T 30989-2014《高通量基因測序技術規(guī)程》、GB/T 35537-2017《高通量基因測序結果評價要求》等文件后,規(guī)定了基于高通量測序進行環(huán)境微生物宏基因組檢測的主要內容,包括樣品采集、保存和運輸,實驗室樣品接收與處理,微生物DNA樣品的制備,提取后DNA樣品判斷質量,后續(xù)文庫構建與高通量測序,數(shù)據(jù)質控要求,數(shù)據(jù)處理過程,結果與報告。
 
  閱讀征求意見稿后可知,標準中所規(guī)定的檢測存在于環(huán)境樣本中微生物的方法原理是,先運用高通量測序技術對環(huán)境樣品中微生物的總體遺傳物質進行測序,然后通過測序結果與現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫中序列的比對來檢測樣品中所含的微生物的種類和相對豐度。而該方法需要高通量測序儀、PCR儀、冷凍離心機、微量移液器、紫外分光光度計、電泳儀、凝膠成像系統(tǒng)、水浴鍋、低溫冰箱等設備。
 
  相信本標準的建立和普及不僅能夠規(guī)范和統(tǒng)一高通量測序的環(huán)境微生物檢測技術流程,還能讓健康、環(huán)境、農業(yè)等涉及微生物檢測的各個行業(yè)有更統(tǒng)一和順暢的評估、交流語境,從而能為全民健康及工農業(yè)技術進步提供有力的保障和支持并促進科研及相關領域經(jīng)濟的發(fā)展。
 
  更多詳情請點擊:《環(huán)境微生物宏基因組檢測 高通量測序法》征求意見稿
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